En 1992 el gobierno paraguayo declaró como reserva para Parque Nacional San Rafael unas 78.000 hectáreas del territorio Mbyá Guaraní, sin contar con el consentimiento de las comunidades indígenas allí asentadas y sin respetar la normativa internacional vigente. Ante esto las comunidades Mbyá iniciaron varias estrategias para la defensa de su territorio tradicional o tekoha guasú. Se presenta en este trabajo la experiencia de construcción de una metodología de mapeo territorial participativo para obtención de resultados válidos para los Mbyá y para las instituciones paraguayas. La información obtenida en el mapeo es propiedad intelectual colectiva del Pueblo Mbyá Guaraní. La agroecología, interesada en las interacciones que se producen entre naturaleza y sociedad, es útil para la incorporación de elementos del conocimiento tradicional en políticas relacionadas al manejo territorial. Se parte de la descripción de las actividades tradicionales de agricultura, caza, pesca, recolección; intentando siempre dar una contextualización histórica y cultural.